
IITA–CGIAR a accueilli une autre édition éclairante de sa série de séminaires mensuels Knowledge Café, avec une présentation captivante par Molecular Breeder, Agre Paterne. Le séminaire hybride, qui s'est tenu le 23 octobre, était axé sur les “ Applications génomiques et bioinformatiques de pointe en sélection d'ignames : Avancées actuelles ”. Modéré par le responsable du programme de sélection du manioc, Ismail Rabbi, la session a mis en lumière les progrès remarquables réalisés dans la sélection de l'igname grâce à l'application d'outils génomiques avancés.
Le Café des Savoirs, organisé par le Bureau de la Communication de l'IITA, sert de plate-forme dynamique pour renforcer la communication interne, promouvoir l'échange de connaissances et encourager l'innovation au sein de l'Institut. Il favorise le dialogue ouvert, la pensée critique et la résolution collaborative de problèmes entre les scientifiques et les partenaires de l'IITA.
En présentant l'intervenant, le rabbin a décrit Paterne comme le responsable de la plateforme de génomique et de génétique de l'igname, louant sa contribution au développement et à l'utilisation des ressources génétiques pour l'amélioration de l'igname à l'IITA et au sein des réseaux mondiaux de sélection variétale. Il a souligné l'expertise étendue de Paterne, couvrant l'analyse de la diversité génétique et de la structure des populations, le développement de marqueurs et la découverte de traits, la prédiction et la sélection génomiques, ainsi que la bioinformatique et la gestion des ressources génétiques.
Le rabbin a en outre noté que Paterne a publié plus de 110 articles scientifiques depuis 2016 et a obtenu une reconnaissance internationale lors de la conférence Advances in Genome Biology and Technology à Orlando, où il a reçu le Next Gen Leadership Award, témoignage de son influence mondiale dans la recherche en sélection moléculaire.
Dans sa présentation, Paterne a souligné l'importance capitale de l'igname (Dioscorea spp.) en tant que culture vivrière et de rente, soutenant plus de 300 millions de personnes en Afrique, avec une valeur socioculturelle significative. Malgré des défis tels que les ravageurs et les maladies, il a mis en avant les avancées majeures réalisées par l'équipe de sélection de l'igname de l'IITA grâce à des innovations basées sur la génomique.
Il a expliqué que l'équipe a développé des outils de sélection génomique (SG) dotés de marqueurs très informatifs pour l'igname, réduisant la durée du cycle de reproduction de quatre à trois ans grâce à l'intégration de la sélection assistée par marqueurs moléculaires et de méthodes améliorées de multiplication des semences.
Paterne a également introduit le Hub du Génome de l'Igname de l'IITA, une base de données innovante conçue pour rationaliser la recherche sur l'igname. Ce hub répond aux défis clés de l'unité d'amélioration des plantes, permettant des recherches rapides d'accessions séquencées et de leurs biomarqueurs, la conversion de fichiers entre différents formats de variants génomiques, ainsi qu'un stockage et une organisation efficaces des marqueurs à l'échelle du génome.
Parmi les réalisations clés de l'équipe, Paterne a mentionné le développement de références génomiques améliorées pour D. alata et D. rotundata; création de marqueurs de contrôle qualité pour la précision de l'amélioration génétique ; déploiement de marqueurs hautement informatifs pour l'avancement des produits ; affinage du pangénome de l'igname en ajoutant plus d'échantillons de séquençage entre les espèces ; et intégration complète des informations génomiques dans la recherche en cours sur l'amélioration de l'igname.
En regardant vers l'avenir, Paterne a révélé que l'équipe de sélection cible l'architecture des plantes comme un trait d'intérêt majeur. “ Nous visons à développer des variétés d'ignames qui ne nécessitent plus de tuteurage, mais peuvent pousser comme des pommes de terre, rendant la culture plus facile et plus accessible aux agriculteurs ”, a-t-il expliqué.
Partageant sa motivation personnelle, Paterne est revenu sur le conseil que son superviseur lui avait donné au début de sa carrière : “ Vos publications parleront pour vous ; personne ne connaîtra votre travail s'il n'est pas partagé. ” Il a encouragé les jeunes scientifiques à publier largement leurs recherches et à construire une communauté de soutien forte et multidisciplinaire qui favorise la collaboration et la croissance.
Grâce à des séminaires tels que le Knowledge Café, l'IITA continue de promouvoir une culture d'innovation et d'apprentissage, garantissant que la recherche scientifique révolutionnaire se traduise par une transformation agricole concrète en Afrique et au-delà.
Contribué par
Ochuwa Favour Daramola